太平洋のド真ん中に位置する、常夏の人工島“絃神島”。この島の彩海学園に通う高校生・暁古城は、ある日クラスメイトの藍羽浅葱、矢瀬基樹との勉強会の帰り道、彩海学園中等部の制服を身につけた見知らぬ少女に後をつけられる。厄介事をさけたい古城だったが、たまたま魔族にからまれたことで内に秘めた吸血鬼の力を見せてしまい――。

古城が住む部屋の隣に引っ越してきた雪菜。必要最低限の家具しかない部屋を見かねた古城は、雪菜を連れてホームセンターへ。さらに妹の凪沙の提案で鍋パーティーを催すなど、賑やかなひと時を過ごしていた。一方絃神島では魔族が襲われるという事件が続いており、その現場には吸血鬼とその眷獣(けんじゅう)を追い詰める殲教師・オイスタッハと少女・アスタルテの姿があった――。

殲教師たちとの戦闘から一夜明け、そこに残されたのは廃墟と化した倉庫街。眷獣の力をはるかに上回る古城の力に驚きを隠せない雪菜だったが、さらに古城が自らの眷獣を制御できないという事実を知るのだった。戦闘から姿を消したオイスタッハたちの行方を追って、とある実験施設へ潜入する古城と雪菜。彼らの目的を知った2人は、再び激しい戦闘を繰り広げる。

オイスタッハたちの進撃は止まらず、ついに人工島の中枢部が襲撃を受けてしまう。さらに浅葱が閉じ込められていることを知った古城は彼女の救出に向かおうとするが、眷獣を操れない己の力の無さに立ち止まる。そんな古城を見かねた雪菜は思いもよらぬ行動に出るのだった。｢1人でその責任を負いきれないというなら、私も一緒に背負います――｣

球技大会開催間近の彩海学園。雪菜と凪沙もチアリーダーとして気合い十分!そして基樹と倫の手回しによって、古城と浅葱もクラス競技のバドミントンにダブルスで出場することになるのだった。一方那月は、倉庫街に現れた獣人たちの捕獲に追われていた。彼らの目的とは果たして。そして同時に、第四真祖である古城を狙う者たちの影が迫る――。

古城たちの前に姿を現したのは、第四真祖にただならぬ愛情を示す公爵・ヴァトラーと、雪菜と同じ獅子王機関に所属している煌坂紗矢華だった。絃神島に潜伏しているテロリストの捕獲を古城に持ちかけるが、代わって名乗り出た雪菜の力量を確かめるべく、ヴァトラーは雪菜に一騎打ちを提案する。そして、今まで幼馴染のポジションだった浅葱の行動にも変化が……?

雪菜を思うあまり、古城に攻撃を仕掛ける紗矢華と、魔力を抑え込めない古城。雪菜の介入で大事には至らなかったが、屋上で反省させられることに。ふたりは雪菜について語り合い、徐々に打ち解ける。しかしその頃、雪菜、浅葱、凪沙がガルドシュと名乗る男によって拉致されてしまった。狙われたのは浅葱のハッキング能力。古城の追跡も間に合わず、ガルドシュの思惑通り古代兵器が起動した！

テロリスト、ガルドシュの策謀により古代兵器ナラクヴェーラが復活。古城と紗矢華は辛くも難を逃れるものの、人工島の深部へと落下してしまう。ナラクヴェーラの制御と解析を急ぐ浅葱。ガルドシュを止めるべく、激闘を繰り広げる雪菜。古城と共に分断され、孤立無援となった紗矢華は古城の吸血鬼の力に己を委ねることを決意。紗矢華の血によって新たな眷獣が出現する――！

黒死皇派による混乱が収束。古城は煌坂紗矢華を新たな知己として迎えつつ、日常へと戻ったが、自らの吸血鬼という正体を浅葱に明かすべきかを悩んでいた。そんな折、古城は妹の凪沙の友人で、中等部の聖女と呼ばれる叶瀬夏音と出会う。同じ頃、謎の飛行体が魔族特区の上空で激突する事案が発生。その破壊を引き起こした者は、絃神島に住む魔族ではなく、人間だと推測された……。

絃神島各地で不穏な激突を行う存在、仮面憑きを迎え撃つべく、古城と雪菜が出動。しかしそこで見た一体の仮面憑きの正体は、あの叶瀬夏音だった。真相を確かめるべく、消息を追う古城と雪菜は、ベアトリスと名乗る女の手引きで、孤島の研究施設へ急ぐ。ところが島に到着した矢先、ベアトリスの策で古城たちは置き去りにされてしまう! 無人島で雪菜とふたりっきり……どうする古城!?

マリンリゾート施設・ブルーエリジアムでバカンスを楽しむ代わりに、施設の飲食店でバイトすることになった古城と浅葱。バイト中に結瞳という少女と知り合った古城は、彼女がとある研究施設から紗矢華の手によって助け出されたことを聞かされる。結瞳達が逃走する際、紗矢華は剣巫の技を使う謎の少女と交戦状態となり、安否不明になっていた。

深夜に目を覚ました古城は、妖艶に変貌した結瞳の姿を目にする。彼女の正体は最強の夢魔・サキュバスで、結瞳の能力に影響された雪菜や浅葱も、上気した表情で古城に迫ってくる……。雪霞狼の力で、なんとかその場は乗り切ったものの、今度は魔導災害専門の国家機関・太子局に所属する妃崎霧葉や、サキュバスの力に操られた紗矢華まで現れて!?

神々が太古に作り出した生体兵器・レヴィアタン。その巨大兵器を結瞳の力で意のままに操ろうとしていたテロリスト・久須木。彼の野望を阻むため、浅葱の協力も得て古城と雪菜はレヴィアタンへと向かう。古城達を妨害しようとする霧葉の相手を紗矢華に任せると、眷獣でレヴィアタンの魔力障壁を突破！内部への侵入に成功する!!

久々に絃神島を訪れた古城の父親・牙城。古城との再会も早々に、凪沙を連れて本土へと舞い戻ってしまう。残された古城が雪菜や友人達と共に年越しの初詣を楽しんでいると、魔法陣が映し出された謎のメールが凪沙から送られてくる。凪沙と連絡が取れないことを不審に思った古城は、浅葱に頼んで牙城の動向を探ってみるのだが――!?

凪沙の安否を確認するため本土へと渡ろうとする古城。しかし那月から思わぬ拘束を受けてしまう。ニーナと夏音の助けで辛くも逃げ出すが、那月の追跡は厳しく、古城は那月の監獄結界へと囚われてしまう……。監獄結界で“本来の姿”の那月と対峙した古城は、助けようと共に巻き込まれた夏音から吸血すると、新たな眷獣を目覚めさせるのだった！

凪沙を連れて本土へと渡った牙城。実家の神緒多神社を訪れると、何故か母親である緋紗乃に拘束されてしまう。神緒多神社のある神縄湖周辺では、獅子王機関と自衛隊によって、とある作戦が決行されようとしていたのだった……。一方、そんな状況を知らず、温泉で羽根を伸ばしていた凪沙のもとに、獅子王機関の“三聖”が一人、闇白奈が現れ――。

本土へ渡り、古城達のもとへと急ぐ浅葱とリディアーヌ。道中で魔獣の群れに襲われるが、褐色の肌をした少年に助けられる。少年の名はイブリスベール。滅びの王朝を統べる第二真祖直系の王子であった。一方、獅子王機関と自衛隊の作戦は、トラブルに見舞われ失敗。どさくさに紛れて拘束を解いた牙城だったが、翼竜に乗った謎の騎士の襲撃を受ける！

神縄湖の湖底に眠っていた龍族の少女グレンダ。彼女の身柄を引き渡すよう要求してくる自衛隊の様子を不審に思った古城が拒否すると、隊員は自衛隊車両をゴーレム化し、古城を襲撃！一連の騒動の黒幕は、自衛隊の中に紛れていた聖殱派のしわざであった。そして古城は、正体を現した聖殱派の魔具の力で虚無世界“ノド”へと送られてしまい――!?

冬休みも終わり、新学期となった絃神島。しかし何者かがしかけた大規模な風水術による結界で、島は孤立状態となってしまう……。この事態を引き起こしているのは“タルタロス・ラプス”と呼ばれる魔導テロ組織の可能性が高いと、古城達に語る那月。そして一方、凪沙の前にはディセンバーと名乗る金髪の美少女が現れ、意味深な言葉を投げかけるのだった。

テロの首謀者と思わしき風水術士・千賀毅人は、那月の昔なじみの人物であった。千賀の操るゴーレムによる破壊活動を阻止するため戦う古城と雪菜だったが、二人の前にディセンバーが現れ、自分が“タルタロス・ラプス”のリーダーであることを明かす。そして謎の力で古城の眷獣は無力化され、絃神島を襲うテロの被害は拡大の一途を辿る……。

絃神島中の魔族から吸い上げられた魔力で生成された巨大な召喚魔法陣“タルタロスの薔薇”。島では薔薇の眷獣が暴れまわり、迎撃に追われる古城達……。島の上空に展開し続ける“タルタロスの薔薇”を止めない限り、事態の収束は見込めない。浅葱や紗矢華の助力を得て、なんとか魔法陣を停止させると、古城はディセンバーとの決戦に臨む。

“タルタロス・ラプス”の引き起こしたテロの傷跡は島中にまだ残っていたが、それでも古城達は日常を取り戻しつつあった。浅葱はテロから島を救ったアイドルとして人気者となり、管理公社の復興支援プロジェクトに駆り出されて大忙し。まさかのＣＤデビューまで果たしてしまう。そして雪菜は、自身の身体に起きつつある異変に悩まされていた。

復興支援プロジェクトに参加していると思われていた浅葱だったが、実は何者かの手によりキーストーンゲートの零階層に幽閉されていた。浅葱を救うべく敵地に潜入する古城と雪菜だったが、彼らの前に絃神冥駕が現れる。古城は冥駕の操る“冥餓狼”により致命傷を受け、その光景を目にした雪菜の力が暴走……。眩い翼が彼女の身を包むのだった。

“聖殲”の力を操る絃神冥駕。世界の理を書き換える規模の禁術の前には、第四真祖である古城の力も届かない……。一方、雪霞狼の副作用により“模造天使”化の進行が著しい雪菜は、このままでは監視者としての役目が果たせなくなる。島での大切な日々に思いを馳せ、涙ながらに「先輩と離れたくない」と訴える雪菜を、古城は強く抱きしめる。

ブルーエリジアムの施設に匿われていたグレンダのもとへ、聖域条約機構からの刺客が現れる。刺客の正体は第一真祖の血脈に連なる古き吸血鬼、ヴェレシュ・アラダール。志緒と唯里が立ち向かうが、力の差は歴然……。なんとか逃げ出したグレンダは古城に助けを求めるが、古城は追ってきたアラダールとグレンダの身柄をかけて決闘するハメとなる。

ヴァトラーが会場として提供したオシアナス・グレイヴⅡで、古城とアラダールの決闘が始まる。勝負の見届人として集まった各国要人の中にはラ・フォリアの姿も。アラダールのスキを突いて先制攻撃に成功する古城だったが、全力を出したアラダールの前に徐々に追い詰められていく。そして決闘の裏では、ヴァトラーのとある計画が進行していた。

聖域条約機構から大規模破壊魔具として認定された絃神島。島を包囲する軍隊に対し、ヴァトラーと組んだ浅葱は武装蜂起。カインの巫女の力を使って“咎神の方舟”を呼び出し、徹底抗戦の構えをみせる。一方、絃神島での戦乱を回避するべく聖域条約機構の中枢である“囁きの庭園”へと直接乗り込んだ古城は、理事会の説得を試みるが……!?

絃神島を巻き込み、自らの欲望を満たすための闘争を求めるヴァトラー。そんなヴァトラーの身勝手な暴挙を止めようとする古城だったが、“聖殲”の力を手にしたヴァトラーの前に為すすべがない……。そして雪菜は、古城を守るために武装蜂起した浅葱と対峙。古城を想うお互いの気持をぶつけ合いながら、激しい戦闘を繰り広げるのだった。

太平洋のド真ん中に位置する、常夏の人工島“絃神島”。この島の彩海学園に通う高校生・暁古城は、ある日クラスメイトの藍羽浅葱、矢瀬基樹との勉強会の帰り道、彩海学園中等部の制服を身につけた見知らぬ少女に後をつけられる。厄介事をさけたい古城だったが、たまたま魔族にからまれたことで内に秘めた吸血鬼の力を見せてしまい…。

古城が住む部屋の隣に引っ越してきた雪菜。必要最低限の家具しかない部屋を見かねた古城は、雪菜を連れてホームセンターへ。さらに妹の凪沙の提案で鍋パーティーを催すなど、賑やかなひと時を過ごしていた。一方絃神島では魔族が襲われるという事件が続いており、その現場には吸血鬼とその眷獣（けんじゅう）を追い詰める殲教師・オイスタッハと少女・アスタルテの姿があった…。

殲教師たちとの戦闘から一夜明け、そこに残されたのは廃墟と化した倉庫街。眷獣の力をはるかに上回る古城の力に驚きを隠せない雪菜だったが、さらに古城が自らの眷獣を制御できないという事実を知るのだった。戦闘から姿を消したオイスタッハたちの行方を追って、とある実験施設へ潜入する古城と雪菜。彼らの目的を知った二人は、再び激しい戦闘を繰り広げる。

オイスタッハたちの進撃は止まらず、ついに人工島の中枢部が襲撃を受けてしまう。さらに浅葱が閉じ込められていることを知った古城は彼女の救出に向かおうとするが、眷獣を操れない己の力の無さに立ち止まる。そんな古城を見かねた雪菜は思いもよらぬ行動に出るのだった。「一人でその責任を負いきれないというなら、私も一緒に背負います――」

球技大会開催間近の彩海学園。雪菜と凪沙もチアリーダーとして気合い十分！ そして基樹と倫の手回しによって、古城と浅葱もクラス競技のバドミントンにダブルスで出場することになるのだった。一方那月は、倉庫街に現れた獣人たちの捕獲に追われていた。彼らの目的とは果たして。そして同時に、第四真祖である古城を狙う者たちの影が迫る…。

古城たちの前に姿を現したのは、第四真祖にただならぬ愛情を示す公爵・ヴァトラーと、雪菜と同じ獅子王機関に所属している煌坂紗矢華だった。絃神島に潜伏しているテロリストの捕獲を古城に持ちかけるが、代わって名乗り出た雪菜の力量を確かめるべく、ヴァトラーは雪菜に一騎打ちを提案する。そして、今まで幼馴染のポジションだった浅葱の行動にも変化が…？

雪菜を思うあまり、古城に攻撃を仕掛ける紗矢華と、魔力を抑え込めない古城。雪菜の介入で大事には至らなかったが、屋上で反省させられることに。ふたりは雪菜について語り合い、徐々に打ち解ける。しかしその頃、雪菜、浅葱、凪沙がガルドシュと名乗る男によって拉致されてしまった。狙われたのは浅葱のハッキング能力。古城の追跡も間に合わず、ガルドシュの思惑通り古代兵器が起動した！

テロリスト、ガルドシュの策謀により古代兵器ナラクヴェーラが復活。古城と紗矢華は辛くも難を逃れるものの、人工島の深部へと落下してしまう。ナラクヴェーラの制御と解析を急ぐ浅葱。ガルドシュを止めるべく、激闘を繰り広げる雪菜。古城と共に分断され、孤立無援となった紗矢華は古城の吸血鬼の力に己を委ねることを決意。紗矢華の血によって新たな眷獣が出現する――！

黒死皇派による混乱が収束。古城は煌坂紗矢華を新たな知己として迎えつつ、日常へと戻ったが、自らの吸血鬼という正体を浅葱に明かすべきかを悩んでいた。そんな折、古城は妹の凪沙の友人で、中等部の聖女と呼ばれる叶瀬夏音と出会う。同じ頃、謎の飛行体が魔族特区の上空で激突する事案が発生。その破壊を引き起こした者は、絃神島に住む魔族ではなく、人間だと推測された…。

絃神島各地で不穏な激突を行う存在、仮面憑きを迎え撃つべく、古城と雪菜が出動。しかしそこで見た一体の仮面憑きの正体は、あの叶瀬夏音だった。真相を確かめるべく、消息を追う古城と雪菜は、ベアトリスと名乗る女の手引きで、孤島の研究施設へ急ぐ。ところが島に到着した矢先、ベアトリスの策で古城たちは置き去りにされてしまう！ 無人島で雪菜とふたりっきり…どうする古城!?